Ziyi Zhou's Blog

人间有味是清欢

Kaggle Learn 学习笔记（2）

Machine Learning

How Models Work 预测，是机器学习的主要任务之一：利用training data，建立model进行fitting/training，最后对新的数据集进行predict。 Explore Your Data 我们使用pandas来查看并对数据集进行操作，如： impo...

Posted by Wenlong Shen on September 27, 2018

Kaggle Learn 学习笔记（1）

Python

Hello, Python! 变量赋值前不需要提前声明，也不需要指定类型。 用#表示注释信息。 通过4个空格或一个tab表示代码块层级，但不要混用。 运算顺序PEMDAS - Parentheses, Exponents, Multiplication/Division...

Posted by Wenlong Shen on September 20, 2018

生物信息分析流程（2）

WDL入门

The Workflow Description Language (WDL) makes it straightforward to define analysis tasks, chain them together in workflows, and parallelize thei...

Posted by Wenlong Shen on September 15, 2018

生物信息分析流程（1）

docker入门

Build, Manage and Secure Your Apps Anywhere. Your Way. 流程化是工业进步的标志，生物学科尚处于基因组学大发现时代，面临着庞杂数据的处理，相应的分析流程必不可少（我早应开发自己的流程工具集，错过第一波的最佳时机，sigh…）。最近被人强...

Posted by Wenlong Shen on September 8, 2018

三十而立

再出发

三十而立却是记忆力衰退，不用笔记录的生活可能就再也记不住了 说是博客，实际就写了点儿不那么专业的专业内容，生活的点滴却被慢慢遗忘。总以为自己还是小孩子，凭着天资小聪明可以在课堂中无忧无虑。怎奈时光无情，恍恍惚惚三十已过，生活早已不是当初的模样，连梦里也看不到未来的自己。一切归于平凡，落于平庸...

Posted by Wenlong Shen on August 29, 2018

Deep Learning Book 学习笔记（20）

Deep Generative Models

玻尔兹曼机 玻尔兹曼机最初作为一种广义的“联结主义”引入，用来学习二值向量上的任意概率分布。我们在\(d\)维二值随机向量\(x\in \{0,1\}^d\)上定义玻尔兹曼机。玻尔兹曼机是一种基于能量的模型,，意味着我们可以使用能量函数定义联合概率分布： \[P(x)=\frac{ex...

Posted by Wenlong Shen on August 18, 2018

Deep Learning Book 学习笔记（19）

Approximate Inference

把推断视作优化问题 精确推断问题可以描述为一个优化问题，有许多方法正是由此解决了推断的困难。通过近似这样一个潜在的优化问题，我们往往可以推导出近似推断算法。 为了构造这样一个优化问题，假设我们有一个包含可见变量\(v\)和潜变量\(h\)的概率模型。我们希望计算观察数据的对数概率\(l...

Posted by Wenlong Shen on July 14, 2018

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